Najwyższą władzą Towarzystwa jest Zebranie Ogólne
Zarząd WTN (kadencja 2007-2011):
| Prezes |
Prof. dr hab. Marian Piekarski |
| Wiceprezesi |
Prof. dr hab. Mieczysław Inglot |
| |
Prof. dr hab. Jacek Kolbuszewski |
| Sekretarz Generalny |
Prof. dr hab. Jan Zarzycki |
| Zastępcy sekretarza generalnego |
Prof. dr hab. Roman Galar |
| Członkowie Zarządu |
Prof. dr hab. Zbigniew Duda |
| |
Prof. dr hab. Antoni Furdal |
| |
Prof. dr hab. Zofia Jasińska |
| |
Prof. dr hab. Krystyn Matwijowski |
| |
Prof. dr hab. Zygmunt Mikołajczak |
| |
Prof. dr hab. Jan Miodek |
Komisja Rewizyjna:
| Przewodniczący |
Prof. dr hab. Otton Dąbrowski |
| Sekretarz |
Prof. dr hab. Tadeusz Więckowski |
| Członkowie Komisji |
Prof. dr hab. Marian Cegielski |
| |
Prof. dr hab. Maria Podolak-Dawidziak |
| |
Prof. dr hab. Jerzy Świątek |
Wydziały:
WYDZIAŁ I – NAUK FILOLOGICZNYCH
| Przewodniczący |
Prof. dr hab. Milica Semków |
| Z-ca przewodn. |
Prof. dr hab. Marian Ursel |
| Sekretarz |
Dr hab. Małgorzata Łoboz |
WYDZIAŁ II – NAUK HISTORYCZNO-FILOZOFICZNYCH
| Przewodniczący |
Prof. dr hab. Jerzy Semków |
| Z-ca przewodn. |
Prof. dr hab. Stanisław Witkowski |
| Sekretarz |
Prof. dr hab. Mateusz Goliński |
WYDZIAŁ III – NAUK PRAWNYCH, EKONOMICZNYCH I ZARZĄDZANIA
| Przewodniczący |
vacat |
| Z-ca przewodn. |
vacat |
| Sekretarz |
vacat |
WYDZIAŁ IV – NAUK PODSTAWOWYCH I INFORMATYKI
| Przewodniczący |
vacat |
| Z-ca przewodn. |
vacat |
| Sekretarz |
vacat |
WYDZIAŁ V – NAUK LEKARSKICH
| Przewodniczący |
Prof. dr hab. Tadeusz Bross |
| Z-ca przewodn. |
Prof. dr hab. Jerzy Rudnicki |
| Sekretarz |
Prof. dr hab. Maria Kotschy |
| Z-ca sekretarza |
Prof. dr hab. Anna Wiela-Hojeńska |
WYDZIAŁ VI – NAUK TECHNICZNYCH
| Przewodniczący |
Prof. dr hab. Danuta Kaczmarek |
| Z-ca przewodn. |
Prof. dr hab. Witold Słówko |
| Sekretarz |
|
WYDZIAŁ VII – NAUK ROLNICZYCH
| Przewodniczący |
Prof. dr hab. Zofia Jasińska |
| Z-ca przewodn. |
Prof. dr hab. Zbigniew Duda |
| Sekretarz |
Prof. dr hab. Grażyna Lisińska |
Komisje:
KOMISJA BIBLIOLOGII I BIBLIOTEKOZNAWSTWA przy Wydziale I
| Przewodniczący |
Prof. dr hab. Maria Pidłypczak-Majerowicz |
KOMISJA JĘZYKOWA przy Wydziale I
| Przewodniczący |
Prof. dr hab. Jan Sokołowski |
Międzywydziałowa KOMISJA HISTORII SZTUKI
|
Struktura 
